Fujitsu クラウドサービス HPC ユーザーガイド

はじめに

「Fujitsu クラウドサービス HPC」は、HPC（ハイパフォーマンスコンピューティング）をオンデマンドで利用可能なサービスです。お客様の研究・開発業務に利用可能な各種のコンピューティングリソースと高速ストレージをご提供します。

本ユーザーガイドでは、「Fujitsu クラウドサービス HPC」の基本的な利用方法をご説明します。ジョブ実行に関するコマンドのオプション等、詳細な情報につきましては、関連ドキュメントのTechnical Computing Suite オンラインマニュアルで公開されている「エンドユーザ向けガイド」もご参照ください。

本書内における表記

表記	内容
$	利用者のシェルプロンプトを示します 本ユーザーガイドでは bash を標準シェルとして使用します
~	利用者のホームディレクトリを示します

商標

商標に関する注意事項

本書に記載されているシステム名、製品名等には、必ずしも商標表示（ (R)、TM ）を付記していません。

関連ドキュメント

• Fujitsu クラウドサービス ドキュメント・料金表

• Fujitsu クラウドサービス HPC FAQ

• コントロールパネルヘルプ

• Technical Computing Suite オンラインマニュアル

• トラブルに関するお問い合わせ

更新履歴

本書の更新履歴を記載します。

版数	更新日	更新内容
第4.1版	2023年12月14日	・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のDevelopment Studioのバージョンを更新しました ・「6.2. Environment Modules」の利用例を更新しました ・「6.4 コンパイラ」の利用方法のDevelopment Studioのバージョンを更新しました
第4.0版	2023年10月12日	・「3.2. ログインノードへの接続」の「Tera Termの公開ホームページ」へのURLを変更しました ・「4.1.1. HPCバジェットの概要」にノード予約サービスに関する説明を追加しました ・「4.2. 利用可能なリソースグループ」にノード予約サービスのリソースグループを追加しました ・「4.5. ジョブ投入」のノード/GPU資源の指定にノード予約サービスに関する説明を追加しました
第3.2版	2023年7月13日	・「3.1. 利用開始までのフロー」の「Fujitsu クラウドサービス HPC」のサービス契約を修正しました ・「3.1. 利用開始までのフロー」に障害・メンテナンス・お知らせの確認を追加しました ・「4.4. ジョブスクリプトの作成」の会話型ジョブのジョブスクリプトにジョブ投入方法の説明を追加しました ・「5.1. ホーム領域」の容量変更が減量に対応したことに伴い、記述内容を変更しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のDevelopment Studioのバージョンを更新しました ・「6.2. Environment Modules」の利用例を更新しました ・「6.4 コンパイラ」の利用方法のDevelopment Studioのバージョンを更新しました ・「6.4 コンパイラ」の利用方法にArmシステム向けの推奨実行時オプションを追加しました ・「6.5 MPI」の利用方法のDevelopment Studio MPIのバージョンを更新しました ・「6.7.1. GROMACS」のx86システムおよびGPUシステムのジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.2. OpenFOAM」の入力ファイルの配備手順およびx86システムのジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.3. Quantum Espresso」のx86システムのジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.4. LAMMPS」のx86システムおよびGPUシステムのジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.5. FrontISTR」のx86システムのジョブスクリプト例を修正しました ・「7. 利用終了手順」の利用終了後の注意事項を修正しました
第3.1版	2023年6月12日	・「1. はじめに」の関連ドキュメントにFAQとトラブルに関するお問い合わせのリンクを追加しました ・「2.2. コンピューティングリソースの詳細」にCPU最大ターボ周波数の情報を追加しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のoneAPI、Intel MPIのバージョンを更新しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のx86システムのOpenFOAMのバージョンを更新し、環境設定方法をmoduleに変更しました ・「6.2. Environment Modules」の利用例を更新しました ・「6.3.1 Spackの利用方法」の利用例を更新しました ・「6.3.2 Spackの環境構築方法」のx86システム用のSpackの環境設定方法を更新しました ・「6.4 コンパイラ」の利用方法を更新しました ・「6.5 MPI」の利用方法を更新しました ・「6.7.5 FrontISTR」のArmシステムのジョブスクリプト例を修正しました ・誤字等を修正しました
第3.0版	2023年2月22日	・「3.1. 利用開始までのフロー」にHPCバジェット（超過料金）抑止およびメールアドレス入力の情報を追加しました ・「4.1.1. HPCバジェットの概要」にHPCバジェット（超過料金）抑止およびHPCバジェット利用休止（基本料金0）の情報を追加しました ・「4.1.2. HPCバジェットの利用状況確認」にHPCバジェット利用履歴およびHPCバジェット（超過料金）抑止の情報を追加しました ・「4.5. ジョブ投入」にMulti-Process Service(MPS)に関する注意事項を追加しました ・「5.4. オブジェクトストレージの利用」の説明文を修正しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」にOpenMPIに関する情報を追加しました ・「6.3. Spack」を「6.3.1. Spackの利用方法」に変更しました ・「6.3.2. Spackの環境構築方法」を追加しました ・「6.5. MPI」にOpenMPIに関する情報を追加しました ・「6.6. Python」にSpackを用いたPythonのインストールを追加しました ・「6.7.1. GROMACS」のジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.2. OpenFOAM」のジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.3. Quantum Espresso」のジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.4. LAMMPS」のジョブスクリプト例を修正しました ・「6.7.5. FrontISTR」のジョブスクリプト例を修正しました
第2.2版	2023年2月1日	・「2.1. 利用イメージ」の最小構成の金額を修正しました ・「2.1. 利用イメージ」のサービス概要およびサービス提供範囲の図を修正しました
第2.1版	2022年11月30日	・「4.1.1. HPCバジェットの概要」の集計期間に関する注意について、集計期間をUTCからJST基準に変更しました
第2.0版	2022年10月28日	・HTML版を公開しました ・「4.4. ジョブスクリプトの作成」の通常ジョブのジョブスクリプトについて、コメント行以降の #PJM の記述が無効ではなく有効になることの説明を修正しました ・「4.5. ジョブ投入」のジョブ投入に関する注意事項に本サービスで利用できない pjsub コマンドのオプションを追加しました ・「4.5. ジョブ投入」からジョブ優先度の指定の項目を削除しました ・「4.8. その他のジョブ操作」のジョブのパラメーター変更からジョブ優先度指定のオプションを削除しました ・「5.2. アプリケーション領域」のアプリケーション領域のパスを修正しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のコンパイラにNVIDIA HPC SDKを追加しました ・「6.1. 利用可能なソフトウェア一覧」のx86システム向けソフトウェアにOpenFOAMを追加しました ・「6.3. Spack」のインストール済みパッケージ一覧にx86システム向けOpenFOAMを追加しました ・「6.4. コンパイラ」にx86システム向けの翻訳オプションの情報を追加しました ・「6.4. コンパイラ」にNVIDIA HPC SDKの利用方法を追加しました ・「6.5. MPI」にMPI処理系ごとの注意事項と実行例を追加しました ・「6.6. Python」のPythonの概要から利用可能なバージョンのpython2.7を削除しました ・「6.7.2. OpenFOAM」にx86システムのジョブスクリプト例を追加しました ・「6.8. Singularity」を追加しました ・「7. 利用終了手順」を追加しました ・ 誤字等を修正しました
第1.0版	2022年10月3日	初版